Pekelné laserové bombardování tajným vojenským satelitem SOL připravilo Tecua (č. 41) o ruku. Kaneda a Kei mezitím stěží unikli smrti umrznutím v tajné místnosti podzemní základny. Náhodou přitom zachrání tajemného chlapce, který má na dlani číslo 28.

Supertajné státní tajemství zvané Akira se konečně zvedá ze svého chladného, ledového hrobu! Aby se Akiry zmocnili, pouštějí se Nezuovy jednotky a vojenské elity řízené plukovníkem za Kanedou a Kei. A co hůř, i hlava nové náboženské sekty paní Mijako přikáže svému služebníkovi Sasakimu, aby se Akiry zmocnil.

Kdo jej tedy nakonec získá? A co bude s Neo-Tokiem, dojde-li skutečně ke katastrofě předpovězené paní Mijako?