Deus Ex: Mankind Divided je přímé pokračování velmi úspěšné a mnohokrát oceněné hry Deus Ex: Human Revolution.\nPíše se rok 2029 a svět se změnil k nepoznání. Z augmentových lidí se stali vyděděnci společnosti, žijící zcela odděleně od zbytku společnosti. Hlavní hrdina hry Adam Jensen je přinucen pracovat ve světě, který začal opovrhovat jeho druhem. Vyzbrojený novým arzenálem smrtících zbraní a augmentací, musí vybrat správnou cestu a spojence, aby mohl odhalit rozsáhlé celosvětové spiknutí.

Deus Ex: Mankind Divided přímo navazuje na jeden z konců Human Revolution. Při Aug incidentu byly všichni mechanicky augmentoví lidé na celém světě zbaveni kontroly nad svou myslí a těly, což mělo za následek smrt miliónů nevinných lidí.\nZlatá éra augmentací je dávno u konce. Všudypřítomná kriminalita a teroristické útoky slouží jen jako zástěrka spiknutí, které má za cíl ovládnout lidstvo a jeho budoucnost. Adam Jensen se proto spojil s Interpolem a tajnou zásahovou jednotkou Task Force 29, jejímž úkolem je potírání augmentových teroristů.